Кращими попередниками льону-довгунцю є озимі зернові, що розміщуються після багаторічних трав, або ярі зернові після удобрених просапних культур (картопля, кукурудза, цукровий буряк). Можна розміщувати льон також після зернових бобових, просапних культур і багаторічних трав. В умовах високої культури землеробства на родючіших ґрунтах багаторічні бобові трави як попередник льону поступаються іншим попередникам. Вони збагачують ґрунт на рухомий азот, що може спричиняти вилягання посівів, інтенсивніше відбувається гілкування, формуються грубші стебла.
У сівозміні льон розміщують так, щоб на попереднє місце він повертався не раніше як через 6-7 років. При частому вирощуванні на одному полі настає "льоновтома" ґрунту, яка виникає внаслідок нагромадження у ньому патогенних грибів, бактерій, вірусів, різних токсичних речовин, виснаження ґрунту, засмічення специфічними бур'янами (підмаренник чіпкий, повитиця льонова, пажитниця льонова та ін.), а рослини сильно пошкоджуються хворобами (фузаріоз, антракноз, поліспороз) та шкідниками.